Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT13P13646 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT13P13646 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT13P13646 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT13P13646 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT13P13646 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT13P13646 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT13P13646 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT13P13646 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms