Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN1P12814 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN1P12814 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms