Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms