Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GLI3P10071 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GLI3P10071 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GLI3P10071 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GLI3P10071 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GLI3P10071 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms