Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR29P0C7W0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR29P0C7W0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms