Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP1P09874 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARP1P09874 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARP1P09874 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARP1P09874 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP1P09874 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP1P09874 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP1P09874 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP1P09874 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP1P09874 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP1P09874 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP1P09874 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP1P09874 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP1P09874 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP1P09874 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP1P09874 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms