Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NGFRP08138 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NGFRP08138 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NGFRP08138 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NGFRP08138 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NGFRP08138 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms