Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPBP07199 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPBP07199 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPBP07199 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPBP07199 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CENPBP07199 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CENPBP07199 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPBP07199 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPBP07199 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPBP07199 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPBP07199 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPBP07199 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPBP07199 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPBP07199 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPBP07199 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPBP07199 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms