Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOC1P02654 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOC1P02654 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOC1P02654 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOC1P02654 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOC1P02654 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC1P02654 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC1P02654 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms