Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms