Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTAP01040 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTAP01040 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTAP01040 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTAP01040 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTAP01040 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTAP01040 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTAP01040 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTAP01040 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTAP01040 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTAP01040 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTAP01040 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSTAP01040 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms