Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX58O95786 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX58O95786 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX58O95786 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX58O95786 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX58O95786 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX58O95786 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms