Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRPM2O94759 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRPM2O94759 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRPM2O94759 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms