Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH4O75427 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH4O75427 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms