Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF253O75346 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms