Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4AO75164 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms