Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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