Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPLO60437 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPLO60437 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPLO60437 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPLO60437 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPLO60437 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPLO60437 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPLO60437 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPLO60437 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPLO60437 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPLO60437 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPLO60437 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPLO60437 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PPLO60437 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPLO60437 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPLO60437 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPLO60437 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms