Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HTRA2O43464 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTRA2O43464 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTRA2O43464 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTRA2O43464 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms