Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASA4O43374 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASA4O43374 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASA4O43374 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASA4O43374 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASA4O43374 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASA4O43374 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASA4O43374 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASA4O43374 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASA4O43374 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms