Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNJ2O15056 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms