Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
O00370 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
O00370 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
O00370 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
O00370 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
O00370 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
O00370 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
O00370 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
O00370 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
O00370 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
O00370 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms