Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DFFAO00273 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DFFAO00273 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DFFAO00273 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DFFAO00273 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DFFAO00273 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DFFAO00273 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms