Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIEO00221 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms