Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C0C1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C0C1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C0C1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C0C1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C0C1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms