Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms