Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms