Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms