Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms