Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYSRT1A8MQ03 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms