Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8AA7E2F4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8AA7E2F4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8AA7E2F4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8AA7E2F4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA8AA7E2F4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA8AA7E2F4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms