Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRIQ3A6PVS8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ3A6PVS8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms