Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms