Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCCD1A6NED2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCCD1A6NED2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCCD1A6NED2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCCD1A6NED2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms