Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD3L3A6NE82 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD3L3A6NE82 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms