Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MEIS3P1A6NDR6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms