Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC66A2RUB6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC66A2RUB6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms