Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLRN2A0PK11 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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