Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms