Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF18Q9Y5U5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms