Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms