Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms