Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES2Q9Y543 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES2Q9Y543 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES2Q9Y543 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HES2Q9Y543 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HES2Q9Y543 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HES2Q9Y543 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HES2Q9Y543 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms