Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NRXN3Q9Y4C0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms