Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms