Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR1DQ9Y2S0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms