Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms