Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRAK1Q9UPV9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK1Q9UPV9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms