Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF24Q9UPV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF24Q9UPV7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms