Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms